Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc177Q3UHB8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms