Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zyg11bQ3UFS0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zyg11bQ3UFS0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms