Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms