Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms