Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms