Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms