Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms