Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd300lgQ1ERP8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms