Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam47cQ14BE7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam47cQ14BE7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms