Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf3ip1Q149C2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms