Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Spatc1Q148B6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Spatc1Q148B6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Spatc1Q148B6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Spatc1Q148B6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Spatc1Q148B6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Spatc1Q148B6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Spatc1Q148B6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Spatc1Q148B6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Spatc1Q148B6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spatc1Q148B6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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