Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms