Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssrp1Q08943 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssrp1Q08943 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssrp1Q08943 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssrp1Q08943 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssrp1Q08943 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms