Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn2Q08093 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms