Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms