Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms