Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr1fQ02284 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms