Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms