Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms