Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1eQ00898 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms