Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms