Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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