Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms