Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cry1P97784 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cry1P97784 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cry1P97784 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cry1P97784 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms