Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SmsP97355 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmsP97355 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmsP97355 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmsP97355 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmsP97355 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmsP97355 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SmsP97355 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmsP97355 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmsP97355 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmsP97355 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmsP97355 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SmsP97355 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SmsP97355 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SmsP97355 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmsP97355 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmsP97355 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmsP97355 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmsP97355 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmsP97355 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmsP97355 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmsP97355 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmsP97355 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmsP97355 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms