Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H3f3aP84244 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms