Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ext2P70428 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ext2P70428 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ext2P70428 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ext2P70428 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms