Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms