Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stra8P70278 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stra8P70278 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stra8P70278 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms