Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms