Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actg1P63260 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms