Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3P62908 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms