Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl31P62900 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms