Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms