Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rab3cP62823 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rab3cP62823 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rab3cP62823 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rab3cP62823 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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