Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhobP62746 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhobP62746 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhobP62746 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhobP62746 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhobP62746 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhobP62746 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhobP62746 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms