Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps13P62301 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps13P62301 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms