Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r1P61809 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms