Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vbp1P61759 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms