Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arl1P61211 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arl1P61211 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arl1P61211 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arl1P61211 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arl1P61211 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arl1P61211 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl1P61211 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms