Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap25P60879 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Snap25P60879 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap25P60879 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snap25P60879 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap25P60879 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap25P60879 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snap25P60879 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap25P60879 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap25P60879 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms