Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms