Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm2P58774 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm2P58774 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm2P58774 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm2P58774 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm2P58774 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm2P58774 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm2P58774 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tpm2P58774 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm2P58774 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm2P58774 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm2P58774 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm2P58774 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tpm2P58774 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm2P58774 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm2P58774 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm2P58774 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm2P58774 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm2P58774 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms