Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ctdsp1P58466 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ctdsp1P58466 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ctdsp1P58466 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ctdsp1P58466 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ctdsp1P58466 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ctdsp1P58466 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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