Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sssca1P56873 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sssca1P56873 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sssca1P56873 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sssca1P56873 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sssca1P56873 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sssca1P56873 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sssca1P56873 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sssca1P56873 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sssca1P56873 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sssca1P56873 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sssca1P56873 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sssca1P56873 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sssca1P56873 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms