Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckbrP56481 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms