Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms