Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GemP55041 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GemP55041 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GemP55041 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GemP55041 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms