Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms