Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RorcP51450 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorcP51450 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorcP51450 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorcP51450 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorcP51450 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorcP51450 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorcP51450 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorcP51450 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorcP51450 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorcP51450 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorcP51450 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorcP51450 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorcP51450 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorcP51450 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorcP51450 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorcP51450 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms